静香着急地拉着大雄的手，大雄也慌了神。
小玉说道：“别担心，我们一起想办法。”
特鲁庞大的身躯向前一步：“俺来挡住他！”
老爹拿着法杖，喊道：“且慢，让我看看这其中的玄机。”
只见老爹念动咒语，法杖顶端射出一道光线，照射在公孙策身上。瞬间，公孙策的身体开始发生扭曲，出现了一道道电流。
“这是未来的电磁改造技术！”成龙惊叫道。
就在这时，公孙策的身体突然爆炸，化作无数个微型机器人，向众人扑来。
“大家小心！”包拯大声喊道。
这些微型机器人速度极快，众人纷纷躲闪。林羽施展轻功，在空中与机器人周旋。
展昭挥剑砍向机器人，却发现这些机器人坚硬无比，剑刃根本无法损伤它们。
神秘女子灵儿再次施展法术，试图控制这些机器人，却也无济于事。
就在众人陷入困境之时，小叮当从他的万能口袋中掏出了一个巨大的吸尘器，喊道：“看我的！”
他启动吸尘器，强大的吸力将微型机器人纷纷吸了进去。
众人刚松了一口气，却发现实验室的墙壁上出现了一个巨大的屏幕，黑暗博士的影像出现在屏幕上。
“哈哈，你们以为这样就结束了吗？这只是个开始！”黑暗博士狂笑着说道。
屏幕上突然显示出一个神秘的装置，不断闪烁着诡异的光芒。
包拯说道：“这想必又是黑暗博士的新阴谋，我们必须尽快找到破解之法。”
众人陷入了沉思，展昭突然开口道：“大人，那公孙先生怎么办？他现在被黑暗博士控制，我们不能丢下他不管啊！”
包拯皱着眉头，神色凝重地说：“展昭，你先照顾好公孙先生，我们其他人从长计议。”
这时，小叮当从他的口袋里掏出了一个时空穿越门，说道：“或许我们可以利用这个回到过去，找到黑暗博士阴谋的源头，从而破解他的计划！”
众人眼睛一亮，包拯思索片刻后说道：“这或许是个办法，但时空穿越充满了未知和危险，我们必须小心谨慎。”
大家决定让小叮当、大雄、胖虎、小夫和静香先带着公孙策通过时空穿越门回到过去，看看能否找到解除控制的方法，而包拯、展昭、林羽、灵儿、王朝马汉张龙赵虎以及成龙、小玉、特鲁、老爹则留下来继续研究当前的情况，寻找其他线索。
小叮当等人带着公孙策穿越到了北宋时期。他们在大街上遇到了包拯年轻时的样子，那时候的包拯还没有成为闻名天下的包青天。
小叮当向包拯说明了来意，包拯虽然感到十分惊讶，但还是决定帮助他们。
然而，他们的行动引起了当地一些恶势力的注意。这些恶势力竟然与黑暗博士有着千丝万缕的联系。
在躲避恶势力追捕的过程中，胖虎不小心弄丢了时空穿越门的遥控器。没有了遥控器，他们无法回到原来的时间。
另一边，包拯等人发现了黑暗博士的一个秘密实验室。在实验室里，他们找到了一些关于时空穿越技术的资料，似乎黑暗博士正在利用这种技术改变历史，以达到他的邪恶目的。
就在他们焦急地寻找小叮当等人时，小夫突然灵机一动，想到可以利用实验室里的材料制作一个简易的时空穿越装置。
经过一番努力，简易装置终于制作完成。包拯等人成功穿越到了北宋，与小叮当他们会合。
众人汇聚后，包拯凭借着他的智慧和推理能力，逐渐揭开了黑暗博士阴谋的一角。原来，黑暗博士企图改变历史，让某个重要的历史事件朝着有利于他的方向发展。
在这个过程中，还发生了许多搞笑的事情。比如，胖虎因为贪吃，差点误了事；小玉则利用自己的功夫，与展昭一起教训了那些恶势力。
最终，包拯等人找到了黑暗博士在北宋时期的爪牙，并成功阻止了他们的阴谋。同时，也找到了让公孙策恢复正常的方法。
随着一道光芒闪过，众人成功回到了现代。他们感慨万分，这次的冒险不仅充满了惊险刺激，还让他们对历史和未来有了更深的认识。
然而，他们还没来得及喘口气，就发现周围的环境有些不对劲。原本熟悉的实验室变得一片狼藉，到处都是闪烁着诡异光芒的仪器碎片。
“这是怎么回事？”林羽惊讶地问道。
包拯眉头紧锁，若有所思地说：“恐怕我们回来的并非是我们离开时的那个现代。”
就在这时，一个神秘的声音在他们耳边响起：“哈哈，你们逃不出我的手掌心！”
众人一惊，四处寻找声音的来源。只见一个黑影从角落缓缓走出，竟然是黑暗博士的得力助手——邪恶女科学家艾莉丝。
艾莉丝冷笑道：“你们以为穿越时空就能摆脱黑暗博士的掌控？太天真了！这里是被科技扭曲的世界，你们就等着受死吧！”
展昭怒目而视：“休要猖狂！”
艾莉丝一挥手，一群机械怪兽凭空出现，向众人扑来。
胖虎吓得哇哇大叫：“这也太可怕啦！”
小夫则躲在静香身后，瑟瑟发抖。
小玉毫不畏惧，与展昭并肩作战，与机械怪兽展开激烈搏斗。
王朝马汉张龙赵虎也纷纷施展拳脚，加入战斗。
神秘女子灵儿再次施展法术，一道道光芒射向机械怪兽，暂时压制住了它们的攻势。
老爹拿出一瓶神秘的药水，对着机械怪兽扔去，药水爆炸，释放出一股强大的能量，将几只机械怪兽炸飞。
然而，就在众人以为局势有所好转时，艾莉丝启动了一个巨大的能量装置，整个空间开始剧烈震动，仿佛要崩塌一般。
“不好，这装置会毁灭一切！”公孙策喊道。
包拯冷静地说：“大家不要慌，一定有办法阻止它！”
小叮当急忙在口袋里翻找着，突然眼睛一亮：“找到了！”他拿出一个小巧的遥控器，上面有着复杂的按钮。
“这是我在未来世界找到的，可以控制任何科技装置的万能遥控器！”小叮当兴奋地说。
就在小叮当准备按下按钮时，成龙喊道：“小心，可能有陷阱！”
但已经来不及了，小叮当按下了按钮，却发现那竟然是一个自毁程序的启动开关。
“哎呀，糟糕！”小叮当吓得脸色苍白。
就在这千钧一发之际，特鲁凭借着他巨大的力量，冲向能量装置，用身体死死地抵住了即将爆发的能量。
包拯喊道：“大家一起帮忙！”
众人齐心协力，终于成功关闭了能量装置，化解了危机。
正当大家松了一口气时，又一个反转出现了，艾莉丝突然消失不见，而黑暗博士却出现在了众人面前。
黑暗博士大笑道：“这只是个开始，游戏还没结束！”