王锡爵认为，地方的财政问题，地方州县州县取携自便，容易造成侵贪。所以要在布政司设立藩库，将留存钱粮大部分解运到布政司的藩库中去，以省委单位，通盘考量支用，加强监管，防止侵吞钱粮。
王锡爵说道：“诸位阁老，下官以为，直省布政司库以贮田赋，为一省出纳收支之总汇。凡存贮动用之处，均宜严加查察，以防弊窦。除照依部文，通行各府州县，遇有实在急切差使，刻不可缓之事，一面备文赴府州县具领，府州即行核明给发，通报查考。如有虚冒情由，即揭报参。”
王锡爵认为，对于藩库，要由地方督抚和巡按御史等在平时严加监察，各布政使都要将藩库银两每月出入情况上报督抚，由督抚题请核销。除了正杂等项动用情况，布政使要按月汇报督抚外。年终布政使还要将一年来藩库钱粮的收支情况上报户部，由户部、户科
一同核查。
参照太仓的管理制度，藩库奏销册中都要开载旧管、新收、开除、实在四柱清册。同时由于藩库涉及布政司和府州地方，还要互相核对。
王锡爵说道：“诸位阁老，下官以为，除了造册报户部审核之外，藩库还应该造具各州县应支、应解清册二分，一存藩司，遇有收支各款。随时填注。一发州县，于年终将己、未支解数目，分款登载铃印，送司磨对。如有不符，立即究办。”
藩库不仅要对户部负责，地方州县正印也有权查看账目，发现不对就可以直接上疏弹劾。
除此之外，官员在升迁、离任以及正署交代之际，也要对藩库动用情况开据清册，接任官员核实之后，出具清册与藩库贮银相符印结，离任官员才算完成对藩库的管理。如果新任布政使在接收藩库时，发现册籍有误就要及时上报户部和皇帝。
王锡爵认为通过这样的方式，能够减少地方的贪墨，使得朝廷对于地方的开支也能够更加清楚的了解。
对于王锡爵的这个建议，阁臣们认为是可行的，长久以来，朝廷对于地方留存钱粮的使用状况确实是茫然无知的，反正任由地方正印支用，有些时候甚至还因此挤占本应起运的钱粮。而朝廷对于这些钱粮的去向实际上是并不知晓的，将这些留存钱粮解运藩库之后，至少可以对州县用了多少钱粮，干了什么事情做到心里有数。
对于这个建议，内阁诸臣都认为可以施行，但是对于六科的变动，内阁就显得不是那么支持了。
王锡爵认为六科既然是监察机关，就应该专司监察，而不是行政，行政有六部负责，与六科无关，六科有什么建议，也应该是直接向皇帝提，有皇帝下部议后施行。同时原来的什么六部和六科的会商也应该取消，六科只负责监察，六部独立行使各自的权力。
这显然不符合内阁的想法。